Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COCHO43405 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COCHO43405 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COCHO43405 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COCHO43405 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COCHO43405 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COCHO43405 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COCHO43405 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COCHO43405 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms