Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms