Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUX2O14529 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUX2O14529 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUX2O14529 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUX2O14529 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUX2O14529 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUX2O14529 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CUX2O14529 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CUX2O14529 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CUX2O14529 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUX2O14529 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms