Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3C2AO00443 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIK3C2AO00443 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms