Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms