Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP3K4Q9Y6R4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MAP3K4Q9Y6R4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms