Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL42Q9Y6G3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms