Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms