Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRRAPQ9Y4A5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRRAPQ9Y4A5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms