Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVW-1Q9UQF0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms