Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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