Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms