Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms