Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms