Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP3Q9UKI2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms