Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBE1Q9UJT0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms