Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms