Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms