Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms