Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HACD3Q9P035 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACD3Q9P035 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD3Q9P035 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD3Q9P035 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD3Q9P035 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms