Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms