Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53CQ9NYF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms