Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms