Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX20

MRPL16, 39S ribosomal protein L16, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL16Q9NX20 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL16Q9NX20 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms