Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms