Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms