Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM28Q9NW13 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms