Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASF1BQ9NVP2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms