Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMSN1Q9NSI8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms