Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TULP4Q9NRJ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms