Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC4Q9NPG8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms