Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC4Q9NPD3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC4Q9NPD3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC4Q9NPD3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC4Q9NPD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms