Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC4Q9NNZ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms