Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms