Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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