Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms