Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms