Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP44Q9C0F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms