Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms