Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms