Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INO80BQ9C086 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INO80BQ9C086 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms