Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUS3Q9BZE2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms