Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms