Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C16orf70Q9BSU1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms