Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms