Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms