Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDX2Q99626 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms