Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POP1Q99575 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POP1Q99575 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POP1Q99575 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POP1Q99575 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POP1Q99575 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms