Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms