Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms